Кафедра «Информационные системы в экономике» была образована в 1993г. На протяжении всего периода функционирования, кафедра меняла название от «Менеджмент и право» (1993-1994гг.), «Информатика» (1994-1996гг.), «Менеджмент и компьютерные технологии» (1996-2000гг.). Начиная с 2000г. кафедра имеет настоящее название «Информационные системы в экономике».
Преподаватели кафедры являются участниками государственной темы «Перспективы развития отрасли информационных технологий в Республике Таджикистан». Для успешного функционирования кафедры и решения поставленных задач, следует отметить вклад доцентов Исаева Р.С., Салимова Н.С., Зайнуддинова С.Н., Азимбоева А., Насруллоевой М.,Юнусова Ш.Ю., ст. преподавателей Сангинова X,., Фузайловой М.С., Курбонова М., Буриева Б., Шамсова Ф., Раљабова А., Тулиева М., и ассистентов Шариповой Дж., Ќурбоновой С. Давлатовой З.
Члены кафедры в течение 2007-2018гг. для учебного процесса студентов подготовили свыше 100 наименований научных статей и учебно-методических материалов. Были созданы соответствующие условия для внедрения кредитной системы образования в университете. Внедрение кредитной системы послужило для повышения качества обучения на основе использования современных информационно-коммуникационных технологий, успешно применяемых в проведении процесса обучения преподавателями кафедры.
Кафедра «Информационные системы в экономике» готовит студентов по специальности 40010202 – информационные системы в экономике и по специальности 250112 – экономическая информатика. Члены кафедры прилагают максимальные усилия для того, чтобы подготовленные специалисты отвечали предъявляемым современным требованиям.
С этой целью члены кафедры на высоком уровне в учебном процессе ведут преподавание таких дисциплин как «Основы алгоритмизации и языки программирования», «Базы данных», «Информационная безопасность», «Язык программирования Delphi», «Язык программирования С++», «Разработка и применение прикладных программ в экономике», «Проектирование информационных систем в экономике», «Моделирование экономических процессов», «ЭВМ, сети и телекоммуникационные системы», «теория оптимального управления экономическими системами» прилагают усилия.
Выпускники кафедры по специальности 40010202 – информационные системы в экономике и по специальности 250112 – экономическая информатика работают на разнообразных предприятиях, банках во всех отраслях народного хозяйства страны и также за рубежом.