Аспирантура Таджикского государственного университета коммерции была создана в 1996 году. Открытие аспирантуры в университете было требованием времени. Университет очень нуждался в подготовке высококвалифицированных научных кадров, в повышении уровня образования, научно-педагогической квалификации преподавательского состава университета и улучшения подготовки кадров для других отраслей народного хозяйства Республики Таджикистан.        Аспирантура Таджикского государственного университета коммерции является логическим продолжением послевузовского образования для лучших выпускников нашего университета и специалистов из других вузов и учреждений.
Огромное уважение к людям, занимающимся наукой, всегда было у нашего народа. Открытие аспирантуры в Таджикском государственном университете коммерции послужило тому, что уважение молодых преподавателей к науке, к человеку с ученой степенью значительно возросло. Среди молодых специалистов поднялся спрос на научно-интеллектуальный труд. А каждая защита диссертации аспиранта в Диссертационном совете является в университете праздником науки. Для аспирантов созданы все условия для научной работы. В их распоряжении находится богатая современная библиотека, оснащенная новейшими технологиями. Библиотека университета только в последние годы пополнилась сотнями экземпляров научной литературы. Аспиранты имеют свободный доступ к компьютерам, Интернет связи, функционирует электронная библиотека, что значительно облегчает работу аспирантов над диссертациями.
Научными руководителями аспирантов являются известные в республике и за его пределами ученые, доктора экономических наук: Хабибов С.Х., Факеров Х.Н., Шарипов М.М., Раджабов Р.К., Исоматов Б.И., Сангинов Н.С., Хамитов М.С. и др.       Молодые исследователи университета с научными идеями и полученными результатами исследования выступают на конференциях и семинарах. Для аспирантов проводятся проблемные лекции и семинары с приглашением ведущих ученых страны. По всем предметам, согласно требованиям программы обучения в аспирантуре, организуются занятия для подготовки и сдачи кандидатских экзаменов.
Только в последние годы в Диссертационном совете университета защитили диссертации и получили дипломы кандидатов экономических наук более 50 молодых ученых, 25 из них являются преподавателями нашего университета. Вхождение молодых преподавателей в клуб ученых с каждым годом в университете становится почетным и престижным, развивает их общение на высоком интеллектуальном уровне.
Наши аспиранты, благодаря своему неустанному труду и поддержке ректора и ведущих ученых вуза, достигли больших результатов. Мы с гордостью можем сегодня констатировать, что еще недавние аспиранты нашего университета сегодня являются руководителями различных звеньев. Например, бывшие аспиранты Мирзоалиев Абдурашид – заведующий кафедрой «Менеджмент», Толибов Кобил – декан факультета «Экономика и менеджмент», Хикматов Сухбатулло – заведующий кафедрой «Товарная экспертиза и таможенное дело», Курбонов Абдукарим – заведующий кафедрой «Банковское дело», Табаров Абдусаме – заместитель декана факультета заочного обучения, Авгонов Сайфулло – заместитель декана факультета «Коммерция и таможенное дело», Табаров Лутфулло заведующий кафедры «Маркетинг и коммерция» и другие.
Молодые ученые нашего университета были отмечены и руководством нашей страны. Главной наградой нашего государства – Премией Исмоили Сомони для молодежи за достижения в области науки и техники были удостоены молодые ученые нашего университета Шаропов Фарход и Джабборов Абдурасул. Кандидаты экономических наук Хусейнова Дильбар и Толибов Кобил за успехи в научно-педагогической работе были награждены Президентом страны Э.Рахмоном ценными подарками.
В аспирантуре ТГУК обучаются не только выпускники нашего университета, но и других высших учебных заведений республики, а также зарубежных стран Афганистана, Ирана и Турции.
В университете создан Совет молодых ученых при поддержке ректора университета и Комитета по делам молодежи при Правительстве Республики Таджикистан. Членами совета являются аспиранты, молодые преподаватели вуза. С 2003 года ежегодно научные доклады аспирантов и соискателей нашего университета занимают первое место по итогам работы данной конференции.